抗癌伴孢晶體蛋白的結(jié)構(gòu)生物學(xué)（開題報(bào)告）

大學(xué)本科畢業(yè)論文(設(shè)計(jì))開題報(bào)告
學(xué)院：化工學(xué)院 　　　　　　　　　　　　　專業(yè)班級：生物工程一班

課題名稱 抗癌伴孢晶體蛋白的結(jié)構(gòu)生物學(xué)

1、本課題的的研究目的和意義：

目的：本研究在已有的研究基礎(chǔ)上，利用蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測手段，對突變蛋白質(zhì)P11、P32的以及未突變蛋白P2Y的空間結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測，以推測P11、P32、P2Y的3D空間結(jié)構(gòu)，再進(jìn)行P11、P32與P2Y二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)間的比較，找出異同點(diǎn)，為今后進(jìn)一步確定其抗癌構(gòu)效關(guān)系的研究奠定基礎(chǔ)。

意義：蘇云金芽孢桿菌（Bacillus thuringiensis，簡稱Bt）是一種分布及其廣泛的革蘭氏陽性細(xì)菌，其在芽胞形成的過程中伴有蛋白晶體的形成，稱為伴
……（新文秘網(wǎng)http://jey722.cn省略515字，正式會(huì)員可完整閱讀）……　
2Y二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)間的比較，找出異同點(diǎn)，為今后進(jìn)一步確定其抗癌構(gòu)效關(guān)系的研究奠定基礎(chǔ)。

成果形式：成果以論文的形式體現(xiàn)



4、 擬解決的關(guān)鍵問題：

對突變蛋白質(zhì)P11、P32的以及未突變蛋白P2Y的空間結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測，以推測P11、P32、P2Y的3D空間結(jié)構(gòu)，再進(jìn)行P11、P32與P2Y二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)間的比較，找出異同點(diǎn)，進(jìn)行分析。




5、研究思路、方法和步驟：

運(yùn)用軟件Discovery Studio Client對目標(biāo)蛋白進(jìn)行同源建模，具體步驟如下：
（1）搜索與目的的蛋白相匹配的模型---同源蛋白，
（2）將目的蛋白與同源蛋白進(jìn)行多重序列比對，
（3）使用 MODELER產(chǎn)生目的序列的模型，
（4）模型的評估，
（5）數(shù)據(jù)分析。
6、本課題的進(jìn)度安排：

2011年10月-11月：文獻(xiàn)查找及熟悉同源建模軟件
2011年11月-2011年12月：運(yùn)用軟件Discovery Studio Client對目標(biāo)蛋白進(jìn)行同源建模
2011年12月-2012年1月：分析數(shù)據(jù)，寫論文
2012年5月-6月：論文的后期處理以及PPT的制作



7、參考文獻(xiàn)：

1、Crystal Structure of the Parasporin-2 Bacillus thuringiensis To*in That Recognizes Cancer Cells,J. Mol. Biol. (2009) 386, 121–133
2、Homology model of RSK2 N-terminal kinase domain, structure-based identification of novel RSK2 inhibitors, and preliminary common pharmacophore,Bioorganic & Medicinal Chemistry 14 (2006) 6097–6105
3、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測實(shí)驗(yàn)指南,岳俊杰，馮華，梁龍主編
4、
5、短小芽孢桿菌木聚糖酶的同源建模及分子動(dòng)力學(xué)模擬,葛慧華, 李紅春, 張光亞,Journal of Huaqiao University (Natural Science),Vol.32 No.3 May.2011
6、大麻素受體CB1三維結(jié)構(gòu)的同源模建及其對接研究,涂國剛 ,李少華,化學(xué)學(xué)報(bào),Vol.69,2011 No. 8,1007～1010
7、抗癌晶體蛋白 Paras pori n2 2空間結(jié)構(gòu)的研究, ……（未完，全文共2273字，當(dāng)前僅顯示1444字，請閱讀下面提示信息。收藏《抗癌伴孢晶體蛋白的結(jié)構(gòu)生物學(xué)（開題報(bào)告）》）